探索建立三级组织管理体系，确保网站政治方向。学校层面成立未名BBS发展委员会，由学校主管领导担任主任，发挥统筹协调作用。青年研究中心作为委员会秘书处，建立有效运行机制，负责具体指导和监管。网络维护和运营主要依靠学生站务组，充分发挥学生自我管理和教育能力。为更加适应当前青年特点，北大率先发起成立国内高校BBS类专门学生社团，以进一步加强引导和管理。